荧光定量（qPCR）结果整理的辅助小工具
荧光定量（qPCR）早已是各个分子生物学实验室常用的 简单的 实验技术。十年的变化很大。10年前（我大一）到实验室时，常规的pcr都不舍得加多0.2ul的rTaq，更不提跑一个qPCR就烧掉大几百的荧光定量。伴随着测序成本的降低和科研经费支持的增加（主要是说我们小打小闹的单位），qPCR实验天天都做，天天都要处理和分析数据。
针对qPCR数据的分析方法有两种，其中一种即为 2deltadelta....（具体请参考荧光定量PCR的随机手册）。虽然事实上，每台机器应该都会有随机软件可以用于分析，但可能多数人还是并不习惯或者喜欢使用该些软件。或许主要原因是....用起来太麻烦。
三四年前，我记得我一直有喊师弟或者师妹去写一个脚本或者软件，这样会简化分析流程，可以省下很多时间。但或许，没有做过定量PCR的师弟或者师妹，并不会了解到，整理结果数据，是一件繁杂和痛苦的事情。
近期，硕士课题组的师兄和师妹希望能有一个相对便捷的，整理qPCR结果的工具，恰好家里网络出了点问题，我便随手写了一个。
需要的输入数据，只有三列，用 制表符分隔 ，用户可以用Excel整理成以下形式，并另存为文本文件， 或者直接新建一个txt文件，并黏贴进去后保存 。
注意，第一个样本，将会作为Control，亦即，可以预计，其计算结果为1
打开工具
拖拽或者通过摁钮选择，设置输入文件
设置一个输出文件路径
点击Start即可得到结果
如上图，结果文件中：
顺手把可视化的也写上，毕竟用Excel加个误差棒还是有点麻烦。
写一个没人写的，顺手加上一些可视化的功能，这样就有种 闭环 的感觉。
很久很久没有更新了，主要原因是....暂时没有发现特别有用的，尤其是对我自己有用的功能。当然，课题组主要做实验的朋友，似乎也不需要新的什么工具。
课题课题....还是要继续想办法。
巴曲7月：答：需要特殊处理并标记显著性。结果呈现: 生成清晰的图片，用星号强调统计结果，并可自定义格式。导出与备份: 最后，导出图片，保留原始格式，以便随时更新或修改。通过以上步骤，你将掌握荧光定量PCR的精髓，灵活应对实验挑战。记住，严谨设计与细心操作是成功的关键。现在，你已经准备好开始你的qPCR之旅了！
巴曲7月：答：现在最常用的两种分析实时定量PCR 实验数据的方法是绝对定量和相对定量。绝对定量通过标准曲线计算起始模板的拷贝数；相对定量方法则是比较经过处理的样品和未经处理的样品目标转录本之间的表达差异。2－△△CT方法是实时定量PCR 实验中分析基因表达相对变化的一种简便方法，即相对定量的一种简便方法。本文介绍...
巴曲7月：答：首先，我们来澄清一些基本术语：RT-PCR与qPCR的主要区别在于，RT-PCR是对RNA进行转录后PCR，而qPCR则是在实时状态下进行定量分析，常用于RNA表达量研究。荧光实时PCR（RT-qPCR）结合了这两者的优点，是实验室中常用的定量工具。在实际操作中，荧光定量PCR的扩增片段控制范围非常重要，通常建议在80-300bp...
巴曲7月：答：将PCR和检测做成一体，就形成了定量PCR仪。还可以与荧光技术结合，同时在每个扩增过程都能实施监控。【应用】 ：定量PCR可以得出准确的定量结果，改变了PCR只用作微量物定性测定的历史，并可进行动态检测和病程疗效分析。同时让质控的建立成为可能，以保证结果的准确性。能对基因突变进行分析。
巴曲7月：答：二者结果相同。都能说明生物体外的特殊DNA复制的整个过程的扩增效率和溶解温度情况。区别：1、二者系统组成不同 荧光定量PCR仪比普通的PCR仪多了荧光信号采集系统和计算机分析处理系统。2、二者原理不同 荧光定量PCR实时监测与DNA结合的荧光染料激发的荧光，普通OCR通过检测插入DNA中核算染料的量来测定PCR最终...
巴曲7月：答：CT-DNA检测结果（copies/ml) 6.06乘以10的8次方 是指在你那取的样本检测出6.06乘以10的8次方个拷贝每毫升的衣原体浓度 UU-DNA ：检测结果（copies/ml)9.55乘以10的5次方 是指在你那取的样本检测出9.55乘以10的5次方个拷贝每毫升的支原体浓度 而检测下限（copies/ml)小于5.00乘以10的二次...
巴曲7月：答：用Ct值，或者delta Ct值表示
巴曲7月：答：何谓荧光实时定量pcr技术，实时荧光定量PCR简介很多人还不知道，现在让我们一起来看看吧！1、中文名：实时荧光定量多聚核苷酸链式反应外文名：Real-timeQuantitativepolymerase chain reaction中文简称：实时荧光定量PCR外文简称：qPCR实时荧光定量PCR （Quantitative Real-time PCR）是一种在DNA扩增反应中，以荧光...
巴曲7月：答：荧光定量pcr原理如下：荧光定量PCR（Real-time PCR），是指在PCR扩增反应体系中加入荧光基团，通过对扩增反应中每一个循环产物荧光信号的实时检测,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。以探针法荧光定量PCR为例：PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针，该探针两端分别标记一个...
巴曲7月：答：所以，就出来啦，结果 对于每组不同部位的比较的话，将其中一个处理为1进行比较吗？如 实验组1 Testis Brain Liver Muscle 可以把任何一个作为1，作为对照，但是要在figure 的legend中注明出来，说清楚就好了！那对于三个组中的同一部位的比较的话，难道也要将其中一组处理为1吗？是的，可以，如 Br...
