如何利用Bio-Rad CFX Manager 3.1分析QPCR数据

来源:网友推荐     更新:2024-05-18
求助BIO-RAD CFX Manager

主要是看收敛残差,如果收敛残差≤设定的值,求解器就会认为已经收敛了,在CFX-solver manager上的曲线表现为两条曲线相交

主要是看收敛残差,如果收敛残差≤设定的值,求解器就会认为已经收敛了,在CFX-solver manager上的曲线表现为两条曲线相交

方法/步骤

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1、百度搜索下载免费的Bio-Rad CFX Manger3.1软件,下载完毕后安装到你电脑上。

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2、在电脑上点开Bio-rad-2软件,会出现一系列的文件夹和应用程序扩展以及应用程序之类的,专门找到应用程序里面的BioRadCFXManager。

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3、点击步骤二中的应用程序。程序开启的速度有点慢,请耐心等待。关掉弹出来的无关窗口,点击File,下拉选择Open,选择横向的Data File,点击Data File,弹出你要选择加进去的QPCR数据文件。

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4、完成步骤三后会弹出你的QPCR曲线结果图。开始对结果图进行分析。首先点击Quantification那栏,看看QPCR的特征曲线跑得怎么样。用鼠标随意点击上面的一条绿色曲线,就出现相对应的哪个孔的Cq值。

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5、开始对曲线进行分析。这里的曲线多数分为两大类,分别代表了两种不同的引物的扩增曲线。曲线中另外出现了两条水平的线,一条在0刻度线处,代表该孔未加染料(QPCR mix);而另一个孔在0-100之间,代表该孔未加模板cDNA,导致无法起峰进入平台期。这两条曲线去掉,不做数据分析。另外跟这两大群主峰的曲线分散比较大的杂曲线,也作为误差较大曲线,数据分析的时候弃掉不用。

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6、点击Melt Curve,一般有几个引物便会出现几个特征性的主峰。并且大部分曲线都会簇拥在它们的主峰里面。将数据导出来分析要返回到Quantification,在Cq值下面右击,出现Export to excel,点击,即可保存为Excel表格,分为07和03版本。

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